Thèse Réponses Adaptatives des Communautés Microbiennes à une Radioactivité Chronique Renforcée dans un Écosystème Contaminé Zone Humide à l'Aval d'Un Ancien Site d'Extraction d'Uranium H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Clermont Auvergne
École doctorale : Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement
Laboratoire de recherche : Laboratoire Microorganismes : Génomes et Environnement
Direction de la thèse : CLARISSE MALLET ORCID 0000000329384995
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-18T23:59:59

L'extraction d'uranium génère une radioactivité naturelle renforcée induisant des risques écologiques durables. La spéciation, la mobilité et la biodisponibilité des radionucléides (RN) dictent leur toxicité environnementale. Dans ce contexte, les communautés microbiennes constituent des bioindicateurs de stress essentiels pour comprendre la résilience des écosystèmes sous exposition chronique. Ce projet de thèse interdisciplinaire, ancré au sein de la Zone Atelier Territoires Uranifères (ZATU), croise écologie microbienne, radiochimie et géochimie pour explorer l'adaptation microbienne et son rôle sur la spéciation des RN. Les objectifs seront 1/ d'analyser les réponses adaptatives physiologiques et moléculaires des communautés (bactéries, diatomées) et d'isolats soumis à une radioactivité chronique renforcée, 2/ d'évaluer l'influence microbienne sur la labilité et la toxicité des RNs. L'étude se focalise sur la zone humide de Rophin caractérisée par un gradient de contamination en RN dans le sol et sédiments du cours d'eau. L'approche combine des suivis in situ et des expérimentations en conditions contrôlées sur des souches tolérantes isolées. Des signatures de biomarqueurs fonctionnels seront établies pour interpréter les réponses des communautés. En complément, une approche génomique et protéomique détaillera les mécanismes cellulaires sous-jacents. Au-delà de la compréhension fondamentale des interactions microorganismes/RN, cette thèse ouvrira des perspectives en bioremédiation.

Travaux de recherche s'intégreront dans les objectifs de recherche de la zone atelier territoires uranifères (ZATU). Le consortium de chercheurs interdisciplinaires s'intéressent à comprendre les effets de la radioactivité naturelle ou naturelle renforcée sur le fonctionnement de socio-écosystèmes, dont une zone humide à l'aval d'un ancien site d'extraction d'uranium.

Master 2 en écologie aquatique ou écologie microbienne.
Travail en conditions stériles, mise en place d'un plan expérimental et réalisation d'expériences en conditions contrôlées. Notions de chimie.